长时间练习快速“颤音”、“打音”、“历音”与各种调式的快速“音阶练习”，可较好地增加手指的灵活性。现在很多笛子教材上都有专门练习手指的练习曲，初学者可以对照教材进行相应的练习。练习过程中要注意：不要为达到速度上的要求而使用蛮力，应注意肢体的放松，手指的按音应具有弹性。好的手指应该是“松、快、准、有力”。其中，“松”是指演奏时不能用力去“捏”笛子，而应是将手指自然松弛地放在笛子上；“快”是指在演奏如颤音、历音及快速音型时快速敏捷；“准”是指手指与气息、舌头的配合要默契，手指的灵活不光是指手指能运动得很快，同时也是指要具有“有效性”，即气、指、舌的有效配合；“有力”是指手指的按音动作具有弹性与力度，手指按音孔时发出轻轻的“梆梆”声。
手指灵活性的练习，也可以在不拿笛子时的日常生活中进行。比如，长时间坐车或看电视时，即可以将手指放在腿上进行练习颤音。
有关手指灵活的练习是一个长期而且持久的过程，长期持续地维持手指的灵活性是一个笛子演奏者永久性的任务。